La flotte de l'Union européenne fréquentant les eaux de l'Océan Indien est composée de deux segments principaux.
1. Le premier est un segment hauturier regroupant :
des métiers à la senne coulissante ciblant les trois espèces de thons tropicaux
o Données 2017:
27 navires actifs
36.035 m³.j de capacité de transport
5.970 jours de recherche et 6.117 jours pêche
223.764 t de captures
YFT 38,8 %
SKJ 53,5 %
BET 7,6 %
des métiers à la palangriers ciblant l'espadon et présentant de captures associées importantes de certains espèces de requins pélagiques
o Données 2017
22 navires actifs
5,697 *106 hameçons mis à l'eau
10.763 t de captures
SWO 42,8 %
BSH 41,8 %
SMA 7,4 %
des métiers à la palangriers ciblant l'espadon et présentant de captures associées importantes de thonidés.
o Données 2017
17 navires actifs ( >12m)
3,067 *106 hameçons mis à l'eau
1.172 t de captures
SWO 42,7 %
YFT & BET 33,0%
ALB 12,9 %
2. Le second est un segment côtier, regroupant des navires de moins de 12 m pratiquant et capturant des grands pélagiques et les espèces associées, utilisant pour certains des Dispositifs à concentration de poissons ancrés comme auxiliaires de pêche autour des deux Régions Ultrapériphériques de l'Union européenne de l'océan Indien, Mayotte et l'île de la Réunion.
Ce segment côtier correspond à des métiers :
à la palangre
o Données 2017
24 unités à la Réunion
0,73 *106 hameçons
305 t de captures
3 unités à Mayotte
89 sorties
138 *103 hameçons
58,2 t de captures
à la ligne de traîne ou à la ligne à main
o Données 2017
152 unités à la Réunion
9.156 sorties environ
755 t de captures
Mayotte : en 2016 145 yoles (141 en 2017) dans le secteur formel professionnel, 369 barques et 729 pirogues dans le secteur informel, production total estimée à 2 050 t (en 2006) et comprise entre 965 et 1320 t en 2013/2015. L'estimation provisoire de capture en 2017, uniquement pour les barques professionnelles, s'élève qu'à 646t.
3. La capacité de pêche de la flotte de l'Union européenne autorisée à développer une activité dans les pêcheries aux grands pélagiques localisées dans a zone de la convention de la CTOI est encadrée par des dispositions portant sur les limites de capacités prévues par les Résolutions de la CTOI et par des textes législatifs de l'Union européenne.
Par ailleurs, les conditions d'accès à certaines zones de pêche dans des eaux sous juridiction d'États côtiers du sud-ouest de l'océan Indien font l'objet de dispositions spécifiques sont définies dans des accords publiques engageant l'Union européenne appelés Accords de Partenariat dans le secteur de la Pêche Durable (APPD).
Conformément à la Résolution 10/02 de la CTOI, Les États membres de pavillon (Espagne, France, Italie, Portugal et Royaume Uni) ont soumis les données scientifiques caractérisant l'activité de la flotte de l'Union européenne ayant développé en 2017 un effort de pêche dans la zone de compétence de la CTOI, permettant au Comité Scientifique de la CTOI de conduire ses travaux.